Le centre de recherche "The Loop Zurich" crée une plateforme centrale pour l'échange de données de santé entre l'Université de Zurich, l'ETH Zurich et les quatre h?pitaux universitaires. Ainsi, les données peuvent être utilisées rapidement et simplement au profit des patientes et des patients.
Lorsqu'une patiente se trouve aux soins intensifs, de nombreux appareils surveillent son état de santé. Entre-temps, une imagerie par résonance magnétique peut être effectuée et, en arrière-plan, des échantillons de sang sont analysés en laboratoire. Tout cela dans le but d'obtenir le meilleur traitement possible. Chaque jour, chaque personne en soins intensifs génère environ 20 Mo de données, voire 100 Go dans certaines situations - une quantité énorme, qui correspond à peu près à la taille d'un film d'une heure.
Si les patientes et les patients acceptent que ces données soient utilisées pour la recherche médicale, les choses deviennent passionnantes. Car c'est surtout lorsqu'une grande quantité de données peut être analysée que l'on peut y voir des modèles de développement de maladies et des thérapies efficaces. Les méthodes d'intelligence artificielle sont de plus en plus souvent utilisées à cet effet et créent la base pour développer des traitements personnalisés, c'est-à-dire adaptés à chaque individu. "Les grandes quantités de données sont une base importante de la médecine de précision", explique Beatrice Beck Schimmer, directrice de la médecine universitaire de Zurich.
Plus de données, plus de connaissances
Ce trésor de données est-il utilisé ? Qu'en est-il dans les quatre h?pitaux universitaires de Zurich, à savoir l'H?pital universitaire de Zurich, l'H?pital pédiatrique universitaire de Zurich, la Clinique universitaire Balgrist et la Clinique psychiatrique universitaire ? "Nous utilisons encore trop peu l'énorme potentiel des données", est convaincue Beatrice Beck Schimmer.
Le problème : aujourd'hui, chaque h?pital utilise son propre système informatique. Les données des patients ne sont pas compatibles avec d'autres systèmes et ne peuvent pas être échangées entre les h?pitaux ni utilisées pour des projets de recherche interhospitaliers. Il manque une infrastructure numérique commune. De même, les h?pitaux individuels manquent parfois de l'infrastructure nécessaire pour gérer de grandes quantités de données.
Une plateforme pour tous
Une solution est désormais en vue. Le centre de recherche The Loop Zurich - une initiative commune de l'UZH, de l'ETH Zurich et des quatre h?pitaux universitaires - veut mettre en place une plate-forme d'informatique biomédicale (BMIP) d'ici 2025. The Loop Zurich a été mandaté par la médecine universitaire de Zurich (UMZH), pour laquelle le gouvernement du canton de Zurich a alloué les fonds nécessaires. Il en résulte une gestion centralisée des données sur la place scientifique zurichoise. "L'objectif est de garantir un échange de données efficace et simple pour tous les chercheurs impliqués. C'est une base importante pour le développement à long terme du site médical de Zurich", explique Michael Krauthammer, informaticien médical à l'UZH et codirecteur de projet de la plateforme biomédicale.
Le deuxième responsable du projet du c?té de l'ETH Zurich est l'informaticien biomédical Gunnar R?tsch. Son groupe développe d'une part des algorithmes d'IA qui apprennent à partir de données biomédicales et qui peuvent être utilisés pour obtenir de nouvelles connaissances. D'autre part, ils travaillent sur des méthodes permettant d'analyser de grands ensembles de données génomiques ou médicales.
Les quatre h?pitaux universitaires impliqués enverront leurs données collectées pour chaque projet de recherche à la nouvelle plateforme. Toutes les données y seront rassemblées, enregistrées et harmonisées - c'est-à-dire mises dans un format permettant l'échange entre les différents h?pitaux. Les biobanques existantes contenant des données précieuses sur les patients, notamment des échantillons de tissus, seront également intégrées à la plate-forme. La solution centralisée sera également nettement moins co?teuse. Les données sur la plate-forme seront soumises aux mêmes exigences strictes en matière de protection des données que dans les h?pitaux.
Retour à l'h?pital
La plateforme informatique biomédicale permettra non seulement le stockage et l'échange de données, mais aussi le développement et l'application en réseau de l'intelligence artificielle . Ainsi, des algorithmes issus d'un projet de l'USZ pourront également être utilisés pour le Balgrist. Car la plateforme n'est pas à sens unique. Les données et les algorithmes peuvent également être exportés vers les h?pitaux. Pour revenir à l'exemple des soins intensifs : De tels algorithmes peuvent y être utilisés, par exemple, pour détecter à temps une détérioration de l'état de santé et prendre les mesures appropriées. Les algorithmes développés sur la plate-forme peuvent également être appliqués directement sur les appareils de l'unité de soins intensifs..
Prêt pour une solution à l'échelle nationale
La plateforme zurichoise sera conforme aux normes telles qu'elles sont actuellement développées dans le cadre du Swiss Personalized Health Network (SPHN). Cette initiative de la Confédération suisse vise à permettre un échange de données de santé à l'échelle de la Suisse pour la recherche. A l'avenir, la plateforme informatique zurichoise pourra être directement intégrée à la solution nationale via une interface et pourrait devenir un modèle national pour la recherche centrée sur les données. Elle devrait en outre contribuer à la collaboration multidisciplinaire en matière de recherche entre l'ingénierie, la médecine et l'informatique .
" Une infrastructure commune pour l'échange de données entre les hautes écoles et les h?pitaux est importante à la fois pour les soins médicaux à Zurich et en Suisse ", déclare Christian Wolfrum, Vice-président pour la recherche de l'ETH Zurich, "les grands ensembles de données biomédicales, tels qu'ils existent déjà aux ?tats-Unis par exemple, sont également indispensables à notre recherche fondamentale pour identifier de manière fiable les causes des maladies et développer des approches de traitement personnalisables pour les patientes et les patients."
Enfin, la plateforme d'informatique biomédicale doit profiter aux patientes et aux patients. Ses données permettront d'améliorer le diagnostic et le traitement de nombreuses maladies, afin qu'ils re?oivent le traitement le plus efficace pour eux, basé sur des preuves.
Il s'agit d'une version légèrement remaniée d'un article paru dans UZH News. Adrian Ritter est journaliste indépendant.