La résistance aux antibiotiques augmente massivement

Dans les pays émergents et en développement, les micro-organismes résistants aux antibiotiques augmentent fortement chez les animaux de rente. Sur une carte, une équipe de recherche internationale dirigée par l'ETH montre pour la première fois où il faut agir le plus. Afin de collecter d'autres données sur la résistance, les chercheurs ont créé une plateforme web ouverte.

Des poulets loin d'être heureux : la résistance aux antibiotiques gagne également du terrain dans l'élevage de volailles. (Image : Colourbox)
Des poulets loin d'être heureux : la résistance aux antibiotiques gagne également du terrain dans l'élevage de volailles. (Image : Colourbox)

Le monde conna?t une croissance économique sans précédent dans les pays émergents et en développement. De plus en plus de personnes en Inde, en Chine, en Amérique latine ou en Afrique sont devenues plus riches, ce qui se traduit par une consommation accrue de viande et de produits laitiers. En Afrique, la consommation de viande a augmenté de plus de la moitié au cours des deux dernières décennies, et de deux tiers en Asie et en Amérique latine.

Pour répondre à la demande croissante, l'élevage a été intensifié, notamment par une utilisation accrue d'antibiotiques. Les agriculteurs utilisent ces médicaments non seulement pour soigner les animaux malades, mais aussi pour prévenir les infections. En effet, lorsque les animaux sont élevés en grand nombre dans un espace restreint et dans des conditions d'hygiène insuffisantes, des maladies se déclarent facilement. Mais les antibiotiques sont également utilisés pour augmenter le poids des animaux.

Les conséquences d'une utilisation inappropriée et excessive des antibiotiques sont toutefois graves : la proportion de bactéries résistantes aux antibiotiques augmente rapidement. Les médicaments perdent ainsi de leur efficacité - ce qui a des conséquences importantes pour la santé des animaux et celle des hommes.

Cartographier les points chauds de la résistance

Les pays en développement et les pays émergents ont souvent peu de capacités pour surveiller l'utilisation des antibiotiques et les résistances dans les exploitations. L'utilisation des antibiotiques y est généralement moins bien réglementée et documentée que dans les pays riches et industrialisés.

Une équipe de chercheurs dirigée par Thomas Van Boeckel, professeur assistant FNS de géographie de la santé et de politique à l'ETH Zurich, vient de publier dans la revue spécialisée "page externeScience" publié une carte de la résistance aux antibiotiques chez les animaux d'élevage des pays en développement et émergents.

Afin de déterminer où et dans quelles espèces d'animaux de rente les résistances aux agents pathogènes Salmonella, E. coli, Campylobacter et Staphylocoque doré les chercheurs ont créé une vaste base de données bibliographiques.

La carte montre le pourcentage de résistance à au moins 50 pour cent des antibiotiques utilisés. Ce pourcentage est particulièrement élevé dans l'est de la Chine. (Graphique : tiré de Boeckel Van T et al., Science 2019)
La carte montre le pourcentage de résistance à au moins 50 pour cent des antibiotiques utilisés. Ce pourcentage est particulièrement élevé dans l'est de la Chine. (Graphique : tiré de Boeckel Van T et al., Science 2019)

Selon cette étude, les animaux du nord-est de la Chine, de certaines régions de l'Inde et du sud du Brésil ainsi que de l'Iran et de la Turquie sont les plus touchés par la résistance aux antibiotiques. Dans ces pays, les bactéries mentionnées sont désormais résistantes à un grand nombre de produits utilisés dans la production de viande et en médecine humaine. Seuls quelques hotspots de résistance se trouvent actuellement en Afrique, à l'exception du Nigeria et de la région de Johannesburg.

La plupart des résistances apparaissent contre les antibiotiques les plus fréquemment utilisés chez les animaux : Tétracyclines, Sulfonamides, Pénicillines et Quinolones. Dans certaines régions, ces substances ont presque totalement perdu leur efficacité antérieure contre les infections.

Tendance alarmante des résistances multiples

Pour suivre l'évolution des résistances multiples, les chercheurs ont créé un nouvel indice. Celui-ci chiffre pour chaque région la proportion d'antibiotiques présentant des taux de résistance supérieurs à 50 pour cent. Dans les pays émergents et en développement, cet indice a presque triplé pour les poulets et les porcs au cours des 20 dernières années. Actuellement, un tiers des antibiotiques échouent dans 50 pour cent des cas chez les poulets et un quart des produits dans 50 pour cent des cas chez les porcs.

"Cette tendance inquiétante montre que les médicaments utilisés dans l'élevage perdent rapidement leur efficacité", déclare Van Boeckel. Selon lui, cela aura des répercussions sur la durabilité de l'industrie de la viande et peut-être aussi sur la santé des consommateurs.

Cette situation est préoccupante, car les résistances augmentent particulièrement dans les pays où la consommation de viande est également en forte croissance et où l'accès aux antibiotiques utilisés en médecine vétérinaire n'est pas suffisamment réglementé. "La résistance aux antibiotiques est toutefois un problème mondial. Cela n'a aucun sens d'essayer d'endiguer la résistance aux antibiotiques à grands frais d'un c?té de la planète alors qu'elle augmente massivement de l'autre", explique le chercheur de l'ETH.

Des milliers d'études ont été intégrées.

Pour leur étude actuelle, des chercheurs de l'ETH, de l'Université de Princeton et de l'Université libre de Bruxelles ont rassemblé des milliers de publications ainsi que des rapports inédits de vétérinaires du monde entier. C'est sur la base de ces données que les chercheurs ont généré les cartes de diffusion des résistances qui viennent d'être publiées pour la première fois.

Les cartes ne couvrent toutefois pas l'ensemble de la zone étudiée, il existe notamment de grandes lacunes en Amérique du Sud, que les chercheurs attribuent à un manque de données accessibles au public. "Il n'y a pratiquement pas de chiffres ou de données officielles pour une grande partie de l'Amérique du Sud", explique Joao Pires, coauteur et post-doctorant de l'ETH. Cela l'a surpris, car il y a beaucoup plus de données disponibles dans certains pays d'Afrique, bien que les ressources pour de telles enquêtes y soient plus limitées qu'en Amérique du Sud.

Développement d'une plate-forme web en libre accès

Afin de diffuser leurs résultats et de collecter d'autres données sur la résistance, les chercheurs ont créé la plateforme web page externeresistancebank.org a été créé. Les vétérinaires ou les autorités, par exemple, peuvent y télécharger de nouvelles données sur la résistance aux antibiotiques dans leurs régions et les partager avec d'autres personnes intéressées. La plate-forme web est librement accessible.

Van Boeckel espère que les femmes scientifiques qui ne peuvent pas se permettre une publication co?teuse dans une revue spécialisée partageront leurs résultats sur la plateforme. "Nous nous assurons ainsi que les données ne prennent pas simplement la poussière dans un tiroir", dit-il, "c'est justement en Afrique ou en Inde que sommeillent de nombreux résultats pertinents qui complètent le tableau global de la propagation de la résistance aux antibiotiques."La plate-forme pourrait également servir aux bailleurs de fonds à identifier les régions les plus touchées par la résistance, afin de pouvoir financer les mesures correspondantes.

Comme la production de viande continue d'augmenter, la plateforme web pourrait aider à mieux cibler la résistance aux antibiotiques et à mettre les régions concernées sur la voie d'une production de viande durable. "Les pays riches du Nord, qui utilisent des antibiotiques depuis les années 1950, doivent aider à réussir cette transition", estime Van Boeckel.

L'étude a été soutenue financièrement par le Fonds national suisse et la Fondation Branco Weiss.

Référence bibliographique

Van Boeckel TP, Pires J, Silvester R, Zhao C , Song J, Criscuolo NG, Gilbert M, Bonhoeffer S, Laxminarayan R. Global trends in antimicrobial resistance in animals in low- and middle-income countries. Science 365, 2019, doi : page externe10.1126/science.aaw1944

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